我院成立于1959年6月，它是浙江省唯一的一所培养高级中医药人才的高等学府，是经国务院批准于1978年首批招收硕士研究生并具有硕士学位授予权的高等中医院校，也是原国家教委和国家中医药管理局批准可对港、澳、台地区招生的首批八所高等中医院校之一。1998年经国务院学位委员会批准，为博士学位授权单位，亦为可以开展在职人员申请硕士学位工作单位。2000年1月经国家教育部批准设置七年制中医学专业。2000年3月整体迁入新校址办学，新址位于钱江南岸杭州市滨江区内，占地286亩（19.06公顷），总建筑面积81000平方米，绿化率35以上。
学院现有教职员工1462人，其中有国家级名老中医15人，具备正高专业技术职称114人，副高专业技术职称429人。目前在校各类学生数3338人。学院设有中医内科博士点及中医、中药、中西医结合三个一级学科的11个硕士点。设有中医学、针灸推拿学、中医骨伤科学、中药学、中医高等护理学、卫生事业管理等本、专科专业。中医临床基础学科是浙江省重点建设学科。中药学、针灸推拿（含气功）学、中西医结合临床学为浙江省重点扶植学科。
学院现有3所附属医院，1所附属门诊部，2所专科门诊部，11所教学医院以及11所实习医院。
学院对外学术交流和校际关系日益发展，国外知名学者、专家经常来院讲学和进行学术交流，同时我院也不断派遣教师出国学习进修，派出教授、专家出国访问讲学和参加国际学术会议，学院留学生教育部每年招收外国留学生、进修生来院学习。
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